Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED7Q9Y3B3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms