Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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