Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms