Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATPIF1Q9UII2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms