Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SRP68Q9UHB9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms