Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT172Q9UG01 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms