Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSRB1Q9NZV6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSRB1Q9NZV6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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