Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms