Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms