Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 MVD-211ENST00000565720 436 ntTSL 322■■□□□ 1.114e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 MVD-209ENST00000565149 2352 ntTSL 1 (best)21.72■■□□□ 1.074e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 AC092073.1-201ENST00000592740 625 ntAPPRIS P1 TSL 321.02■□□□□ 0.964e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 MVD-217ENST00000569177 870 ntTSL 520.51■□□□□ 0.874e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 MVD-215ENST00000568133 853 ntTSL 320.03■□□□□ 0.84e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 MVD-206ENST00000563170 904 ntTSL 319.99■□□□□ 0.794e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 GPI-204ENST00000586392 1706 ntTSL 218.33■□□□□ 0.524e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.374e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.334e-7■□□□□ 8.7
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AATFQ9NY61 DENND4B-202ENST00000368646 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.76□□□□□ -0.054e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.074e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.084e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.094e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 GPI-203ENST00000586077 3053 nt11.78□□□□□ -0.524e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.694e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 BUB1B-205ENST00000558715 580 ntTSL 316.21■□□□□ 0.192e-8■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 BUB1B-207ENST00000559414 526 ntTSL 415.33■□□□□ 0.042e-8■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 BUB1B-211ENST00000560120 583 ntTSL 315.25■□□□□ 0.032e-8■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 BUB1B-202ENST00000412359 3628 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.792e-8■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 BUB1B-201ENST00000287598 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.82e-8■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 GLUL-212ENST00000491322 6132 ntTSL 1 (best)11.07□□□□□ -0.641e-6■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 STAT5B-203ENST00000468312 1799 ntTSL 1 (best)27.39■■□□□ 1.982e-9■□□□□ 8.6
AATFQ9NY61 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-9■□□□□ 8.6
AATFQ9NY61 STAT5B-202ENST00000415845 559 ntTSL 48.03□□□□□ -1.122e-9■□□□□ 8.6
AATFQ9NY61 SDF2L1-202ENST00000466935 601 ntTSL 230.6■■■□□ 2.496e-9■□□□□ 8.6
AATFQ9NY61 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.336e-9■□□□□ 8.6
AATFQ9NY61 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.766e-9■□□□□ 8.6
AATFQ9NY61 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.046e-9■□□□□ 8.6
AATFQ9NY61 RPS6-202ENST00000380381 892 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.576e-9■□□□□ 8.6
AATFQ9NY61 RPS6-204ENST00000380394 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.76e-9■□□□□ 8.6
AATFQ9NY61 FUS-203ENST00000474990 827 ntTSL 327.78■■■□□ 2.041e-7■□□□□ 8.6
AATFQ9NY61 FUS-213ENST00000570090 544 ntTSL 221.89■■□□□ 1.091e-7■□□□□ 8.6
AATFQ9NY61 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.572e-8■□□□□ 8.6
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AATFQ9NY61 CNOT1-212ENST00000567285 722 ntTSL 47.65□□□□□ -1.181e-323■□□□□ 8.6
AATFQ9NY61 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.261e-323■□□□□ 8.6
AATFQ9NY61 CNOT1-211ENST00000567188 7830 ntTSL 1 (best)6.77□□□□□ -1.331e-323■□□□□ 8.6
AATFQ9NY61 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.631e-323■□□□□ 8.6
AATFQ9NY61 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.841e-323■□□□□ 8.6
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AATFQ9NY61 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.571e-27■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 LUC7L3-214ENST00000508482 1597 ntTSL 216.51■□□□□ 0.231e-27■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.631e-27■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 LUC7L3-219ENST00000511974 507 ntTSL 35.7□□□□□ -1.51e-27■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 LUC7L3-205ENST00000504065 1071 ntTSL 54.99□□□□□ -1.611e-27■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 LUC7L3-216ENST00000509487 647 ntTSL 33.86□□□□□ -1.791e-27■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 LUC7L3-203ENST00000503728 783 ntTSL 52.78□□□□□ -1.961e-27■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 LUC7L3-222ENST00000513969 419 ntTSL 30.84□□□□□ -2.271e-27■□□□□ 8.5
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AATFQ9NY61 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.87■□□□□ 0.612e-7■□□□□ 8.5
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AATFQ9NY61 SRGAP2B-204ENST00000612199 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.722e-7■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 SRGAP2B-206ENST00000621582 486 ntTSL 55.69□□□□□ -1.52e-7■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.853e-6■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 GPCPD1-206ENST00000481690 819 ntTSL 327.19■■□□□ 1.943e-6■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.073e-6■□□□□ 8.5
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AATFQ9NY61 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.22■□□□□ 0.513e-6■□□□□ 8.5
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AATFQ9NY61 SEC61G-207ENST00000480303 661 ntTSL 1 (best)10.67□□□□□ -0.73e-6■□□□□ 8.5
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AATFQ9NY61 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.033e-6■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.13e-6■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 SEC61G-206ENST00000461536 437 ntTSL 25.15□□□□□ -1.593e-6■□□□□ 8.5
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AATFQ9NY61 ALDOA-215ENST00000565355 538 ntTSL 518.88■□□□□ 0.614e-20■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.554e-20■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.514e-20■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.414e-20■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.354e-20■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 ALDOA-217ENST00000566130 801 ntTSL 217.14■□□□□ 0.334e-20■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.34e-20■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.284e-20■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.244e-20■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.184e-20■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 ALDOA-211ENST00000564521 2534 ntTSL 515.01□□□□□ -0.014e-20■□□□□ 8.5
AATFQ9NY61 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.351e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.311e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 TRMT2A-209ENST00000463710 757 ntTSL 320.88■□□□□ 0.931e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 TRMT2A-212ENST00000471040 848 ntTSL 320.88■□□□□ 0.931e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 P4HB-202ENST00000415593 1669 ntTSL 1 (best)20.08■□□□□ 0.811e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 TRMT2A-217ENST00000488335 379 ntTSL 319.84■□□□□ 0.771e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 P4HB-220ENST00000575069 2453 ntTSL 217.78■□□□□ 0.441e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 DDIT4-202ENST00000471240 521 ntTSL 226.16■■□□□ 1.784e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 DDIT4-203ENST00000473155 753 ntTSL 1 (best)25.35■■□□□ 1.654e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.64e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 CAP1-216ENST00000449311 681 ntTSL 520.94■□□□□ 0.944e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 FASN-210ENST00000636968 100 ntTSL 520.59■□□□□ 0.894e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 CAP1-211ENST00000421589 824 ntTSL 219.9■□□□□ 0.784e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 FAR1-205ENST00000532701 1109 ntTSL 219.73■□□□□ 0.754e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 CAP1-210ENST00000420216 668 ntTSL 517.8■□□□□ 0.444e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.424e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 CAP1-208ENST00000414893 528 ntTSL 316.82■□□□□ 0.284e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 MAPK6-203ENST00000558100 514 ntTSL 216.27■□□□□ 0.24e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.114e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 CAP1-209ENST00000417287 610 ntTSL 515.69■□□□□ 0.14e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 CAP1-214ENST00000435719 817 ntTSL 315.61■□□□□ 0.094e-6■□□□□ 8.4
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