Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMPD3Q9NY59 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMPD3Q9NY59 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMPD3Q9NY59 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMPD3Q9NY59 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMPD3Q9NY59 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMPD3Q9NY59 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMPD3Q9NY59 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMPD3Q9NY59 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMPD3Q9NY59 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPD3Q9NY59 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms