Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG3Q9NT62 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms