Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms