Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms