Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCRT2Q9NQ03 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms