Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms