Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms