Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms