Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC28A3Q9HAS3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms