Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms