Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG10Q9H0Y0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms