Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.065e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-208ENST00000414711 673 ntTSL 515.19■□□□□ 0.025e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.065e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-215ENST00000437100 826 ntTSL 513.58□□□□□ -0.245e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-206ENST00000412056 998 ntTSL 312.92□□□□□ -0.345e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.565e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 RBM12-206ENST00000435161 565 ntTSL 411.1□□□□□ -0.635e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 RBM12-205ENST00000431148 583 ntTSL 410.75□□□□□ -0.695e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-218ENST00000439806 748 ntTSL 59.46□□□□□ -0.95e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 AL109827.1-201ENST00000454607 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.38□□□□□ -0.915e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 AL109827.1-202ENST00000441563 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.38□□□□□ -0.915e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.935e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-6■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CLCF1-202ENST00000533438 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.711e-6■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 EDEM1-206ENST00000465369 1956 ntTSL 521.23■□□□□ 0.991e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 EDEM1-205ENST00000465187 585 ntTSL 420.4■□□□□ 0.861e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.411e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.391e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 EDEM1-202ENST00000434243 978 ntTSL 212.62□□□□□ -0.391e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.124e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.482e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.462e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 TMEM8A-208ENST00000476735 801 ntTSL 516.62■□□□□ 0.252e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 TMEM8A-203ENST00000427313 587 ntTSL 411.59□□□□□ -0.552e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 IQSEC1-203ENST00000474467 436 ntTSL 37.61□□□□□ -1.197e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 SMCHD1-206ENST00000581631 729 ntTSL 36.67□□□□□ -1.343e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 SMCHD1-203ENST00000577880 4951 ntTSL 22.98□□□□□ -1.933e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 SMCHD1-211ENST00000584897 4143 ntTSL 22.62□□□□□ -1.993e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 AC073111.4-201ENST00000483664 582 ntTSL 412.18□□□□□ -0.463e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.932e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.121e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.393e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.063e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.269e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.419e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 B3GNTL1-202ENST00000570947 390 ntTSL 310.44□□□□□ -0.749e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.186e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.136e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.316e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-217ENST00000609442 555 ntTSL 312.74□□□□□ -0.376e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-205ENST00000573075 556 ntTSL 412.64□□□□□ -0.396e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-207ENST00000574016 557 ntTSL 412.36□□□□□ -0.436e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-213ENST00000608198 578 ntTSL 512.26□□□□□ -0.456e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-219ENST00000610106 450 ntTSL 511.94□□□□□ -0.56e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-209ENST00000575626 624 ntTSL 311.94□□□□□ -0.56e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.516e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-203ENST00000571091 525 ntTSL 211.63□□□□□ -0.556e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.556e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-218ENST00000609990 610 ntTSL 511.63□□□□□ -0.556e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-215ENST00000608913 570 ntTSL 511.4□□□□□ -0.586e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-216ENST00000609398 584 ntTSL 511.4□□□□□ -0.586e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-214ENST00000608245 465 ntTSL 511.4□□□□□ -0.586e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-210ENST00000576489 648 ntTSL 411.4□□□□□ -0.586e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-211ENST00000576749 754 ntTSL 211.12□□□□□ -0.636e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR22HG-202ENST00000570416 535 ntTSL 36.89□□□□□ -1.316e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 GIPR-206ENST00000591224 782 ntTSL 215.14■□□□□ 0.012e-9■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 GIPR-208ENST00000593127 153 ntTSL 59.95□□□□□ -0.822e-9■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.091e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 ARAP1-210ENST00000465814 5612 ntTSL 214.23□□□□□ -0.131e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 SDC3-203ENST00000471567 589 ntTSL 314.21□□□□□ -0.132e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.231e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.321e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.321e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.351e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.571e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 INO80-205ENST00000558357 5503 ntTSL 1 (best)10.83□□□□□ -0.681e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.771e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 ARAP1-207ENST00000429686 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.891e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.1■■■□□ 2.091e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.691e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.931e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 RPL22-204ENST00000465387 508 ntTSL 220.21■□□□□ 0.831e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.741e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 PPP1R37-204ENST00000540059 1719 ntTSL 219.61■□□□□ 0.739e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 RPL22-206ENST00000480661 2279 ntTSL 1 (best)18.12■□□□□ 0.491e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MAP7D1-210ENST00000527764 945 ntTSL 217.57■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MAP7D1-205ENST00000429533 959 ntTSL 316.84■□□□□ 0.291e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 PPP1R37-202ENST00000422370 5943 ntTSL 1 (best)16.8■□□□□ 0.289e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.021e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 RPL22-203ENST00000465335 806 ntTSL 314.98□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.547e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 ZBTB22-209ENST00000441117 581 ntTSL 1 (best)11.69□□□□□ -0.541e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MAP7D1-211ENST00000530729 567 ntTSL 310.42□□□□□ -0.741e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 RPL22-201ENST00000234875 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 PCBD2-202ENST00000504352 961 ntTSL 58.96□□□□□ -0.981e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 RPL22-202ENST00000462296 600 ntTSL 37.92□□□□□ -1.141e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 KLHDC4-221ENST00000568346 343 ntTSL 47.88□□□□□ -1.154e-10■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 SGMS1-211ENST00000626236 1013 ntTSL 1 (best)7.82□□□□□ -1.161e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.171e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.261e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 RPL22-205ENST00000471204 524 ntTSL 25.67□□□□□ -1.51e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 SGMS1-207ENST00000602619 461 ntTSL 34.58□□□□□ -1.681e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.253e-9■■■■□ 21.4
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