Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms