Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BCL11BQ9C0K0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCL11BQ9C0K0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms