Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E2

XPO4, Exportin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPO4Q9C0E2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPO4Q9C0E2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms