Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BARHL1Q9BZE3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms