Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC2Q9BYS8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC2Q9BYS8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms