Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTCH4Q99466 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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