Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms