Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms