Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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