Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms