Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00479Q96M42 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms