Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms