Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms