Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STAMBPL1Q96FJ0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms