Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX11Q96FC9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms