Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms