Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
UPRTQ96BW1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms