Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF1Q92879 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms