Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIFAP3Q92845 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms