Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBLCP1Q8WVY7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms