Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms