Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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