Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms