Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms