Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLD3Q8IV08 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms