Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUG1

KRTAP1-3, Keratin-associated protein 1-3, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-3Q8IUG1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-3Q8IUG1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRTAP1-3Q8IUG1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms