Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms