Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRINP3Q76B58 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BRINP3Q76B58 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRINP3Q76B58 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
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